ゲームよりも熱血漢でバトル好きなキャラになっており、武器や魔法は一切使わず叫びながらラッシュを掛けてマリオをボコボコにする。だがマリオは事前にピーチ姫によって彼女の魔力を注入されており、土壇場で覚醒。ピーチ姫の姿に変身したマリオの「フライパンチ（フライパンで殴る）」によりダメージを受ける。これによりジョナサンは熱い一撃に心打たれ味方になった（負けたわけではなく感動して戦意喪失しただけで、まだまだ余力はあった）。

最終話ではヤリドヴィッヒ戦に駆け付けマリオたちの応援に回っていた。マリオにサシの勝負をさせたがっていたが、仲間全員の総攻撃で勝利したのを見てその熱さに感激する。

余談

ジョナサン戦以降、ジョナサンの頭の上に乗ると「おいおい。見事なジャンプだが、人の頭の上には乗んねェほうがいいぜ。」とツッコまれる。

その名前の構成から、某長編漫画に登場する初代主人公、もしくは歴代主人公の愛称を連想させる。海外版ではJonathan"Johnny"Jonesとなっている。本名がジョナサン、愛称がジョニー（ジョニィ）なので、むしろSBRのジョナサンの方が近い。

また、ガチで勘違いされたのかネタなのかは不明だが、この漫画を頻繁にパロディしていた別漫画のキャラクター人気投票回において、彼の名前が登場したことがある。

サメをモチーフにした敵キャラというと6つの金貨に登場したジョーを連想したプレイヤーも多いのではないだろうか。

ちなみにスーパーマリオくんの7巻では、ジョーがリングの中でマリオとサシの勝負（ボクシング）を行っており、ジョナサン戦と共通点が見られる（ちなみに9巻ではヨッシーと1対1の勝負を繰り広げて敗北している）。

沢田も意識したのか、51巻に登場するジョナサンは拳のみでマリオと戦っていた。

ちなみにマリオくんの前身に当たる著作『スーパーマリオブラザーズ2』では、似たような立ち位置のキャラクターとして巨大なゲッソーが登場する。

「海の中の死闘を通してマリオと友情を結んだ海洋生物モチーフの敵」「二人の間に横槍を入れて来た刺客をマリオと協力して撃破する」という部分がジョナサンと酷似している。また巨大なゲッソーもマリオRPGにボスとして登場した。

以下、リメイクのネタバレ注意！

男の勝負、再び

リメイク版では、エンディングクリア後に沈没船に向かうと再びジョナサンと勝負できる。

注意しておきたいのが、今回は終始マリオと一騎打ちのタイマン勝負であり、しかもアイテムも禁止される。回復が一切できないため、挑む前にマリオのレベルをしっかり上げて装備を整えてから勝負に挑み、極力ダメージを最小限に抑えながらダメージを与えていきたいところ。防具のひまんパタこうらを装備し、なかまボーナスを継続していれば被ダメージを1に抑えられる。なおマロが戦えないため、倒すだけでなにかんがえてるのも見れる。

勝利すると火花を散らした大勝負の証として、ぴっかぴかいしというアイテムをくれる。海の底に沈んでいたらしく、神秘的な光を放っている。これを彼を倒した後に、あの場所へ持っていくと……。

ちなみにED後の強化版での解説では「燃えたよ・・・・真っ青に燃えつきた・・・・」とコメントしている。