治安の方は強盗だけでも日本の510倍という発生率な上、麻薬組織との銃撃戦も頻発するレベル。実際、現地入りした選手団が強盗の被害に遭ったり、ドイツのテレビクルーが、放送機材を積んだトラックを強奪されるなどの被害が報告されている。ブラジル政府は、大会期間中全土から軍や警察など約85000人を動員し警備に当たらせるとする一方、リオ州では財政難により警官や消防士への給与の支払いが滞り、これに反発した警官らがストライキを行ったほか、国際空港の到着ロビーに、「地獄へようこそ」と書かれた横断幕を掲げて座り込みをする異例の事態になっている。また消防士が選手村で火事場泥棒を働く事件も発生。

各国でも選手達や参加者に「スマートフォンを会場外で出して歩かない」などの防犯注意喚起を行っている。

環境面でも下水処理などが不十分なためセーリング会場であるグアナバラ湾の水質汚染は酷く、「スプーン3杯分の水でウイルス感染症にかかる」とすら言われている(公害問題は2022年の北京冬季でも大気汚染が懸念されている)。またジカ熱蔓延の問題も南米全土で発生しており早くから妊婦の観戦を止めるよう日本でもアナウンスされており、選手の家族達も現地応援を控えた者が少なくなかった。

これに加えて、ブラジル国内の政治もジルマ・ルセフ大統領の汚職疑惑で混乱しており、これにより大統領は五輪期間中を含む180日の職務停止を食らっていたため開会式は副大統領が代行、大会前からデモが多発しており、五輪の不安要素の解決を難しくしている。

会場建設はギリギリまでの突貫工事を行ってどうにか間に合わせたが、選手村の設備は「トイレがすぐ詰まる」など不備が多く選手村を拒否する国もあった。また治安の問題も全く解決出来ておらず、日本人を含む観客が置き引きや強盗に遭うだけでなくポルトガルの教育相までもが強盗に遭っている。

選手の方もモロッコとナミビアのボクシング男子選手が選手村の女性スタッフ相手に暴行を働くなど無茶苦茶な状況は続いている。

「予約したはずの練習場所があいていない」「流す国歌を間違える」「プールの消毒用薬剤が足りず藻で緑色になり悪臭」「選手村現地スタッフが選手団の荷物を盗難」などのトラブルは頻発し、チケットの売れ行きも決して芳しくはなかったが大筋では滞ることなく予定通り最後まで進行した。

日本選手の成績

ロンドンオリンピックで惨敗に終わった柔道が一転して好調、男子は全階級でメダルを獲得した。女子ではレスリング・バドミントンが好調で、特に女子レスリングは金メダル4つに銀1つという凄まじさである。

また、男子卓球・カヌー・バドミントン・競歩など日本勢初のメダル獲得を成し遂げた競技や、テニスや競泳800mリレー・女子平泳ぎ200mのような「数十年振りのメダル獲得」といった記録的なメダル受賞の目立った大会でもあった。

メダル獲得に至らなかった種目でも、本大会より採用された7人制ラグビーの日本代表が、優勝候補と言われた格上を次々と打ち破ってベスト4に進出し、体操女子が過去最高の順位(4位)を得る等大健闘を見せた。

反面、前回大会で男女ともにベスト4へと進出したサッカーは不調に終わった(男子は1次リーグ敗退、女子に至ってはオリンピック本大会への出場を逃すというまさかの展開に…)。

最終的なメダルの獲得枚数は、金メダルが12枚、銀メダルが8枚、銅メダルが21枚の合計41枚。これは夏・冬を通じて過去最多のメダル獲得数であり、自国開催である4年後の東京オリンピックへ向けて大きく弾みをつける結果となった。

日本人メダリスト

金メダル

萩野公介(競泳男子個人メドレー400m)※銅メダルの瀬戸と日本競泳勢60年ぶりのダブル表彰台。
金藤理絵（競泳女子平泳ぎ200m）※24年ぶり、日本勢歴代3人目のメダル獲得。
体操男子団体(内村航平/白井健三/田中佑典/加藤凌平/山室光史)

※決勝は内村、白井、田中が出場

内村航(体操男子個人総合)※44年ぶりの個人総合連覇)
大野将平(柔道男子75kg級)※今大会、日本柔道勢初のメダル獲得。
ベイカー茉秋(柔道男子90kg級)※日本初の90㎏級メダル獲得。
田知本遥(柔道女子70kg級)※今大会、女子金メダル獲得1号。
登坂絵莉(レスリング女子フリースタイル48kg級)※五輪初出場で金メダル獲得。
伊調馨(レスリング女子フリースタイル58kg級)※五輪史上初女子個人種目4連覇。
土性沙羅(レスリング女子フリースタイル69kg級)※五輪初出場で金メダル獲得。
川井梨紗子(レスリング女子フリースタイル63㎏級)※五輪初出場で金メダル獲得。
バドミントン女子ダブルス(髙橋礼華/松友美佐紀)※日本バドミントン界初のメダル獲得。

銀メダル

坂井聖人(競泳男子200mバタフライ)
萩野公介(競泳男子200m個人メドレー)
原沢久喜(柔道男子100㎏超級)
太田忍(レスリンググレコローマン男子59kg級)
樋口黎(レスリングフリースタイル男子57kg級)
卓球男子団体(水谷隼/丹羽孝希/吉村真晴)※男子団体初のメダル獲得。
吉田沙保里(レスリング女子フリースタイル53㎏級)
陸上男子400mリレー(山県亮太、飯塚翔太、桐生祥秀、ケンブリッジ飛鳥) ※ 北京大会の銅メダル以来2大会ぶりのメダル。銀メダルは過去最高の成績であり、日本記録およびアジア記録も更新した。